企业网银手续费是银行为企业客户提供的一种金融服务，以便于企业进行电子银行业务操作、资金管理和支付结算。手续费的收取方式通常由银行根据业务性质、交易金额和服务级别等因素来确定，以下是一般的手续费收取方式：

1. 交易手续费：企业在网银平台上进行各类交易操作，如转账、支付、收款等，银行会按照交易金额收取一定的手续费，费率一般根据交易规模和金额等因素而定。

2. 开通费用：企业在申请开通网银服务时，银行可能会收取一定的开通费用，用于激活和配置企业的网银账户，确保顺利使用网银服务。

3. 年费：有些银行对企业网银账户会收取一定的年费，以覆盖维护和管理网银系统的成本。

4. 短信认证费：为了增加交易的安全性，银行通常会通过短信验证码等方式对企业进行身份认证，而这些短信认证的费用可能会由企业承担。

5. 证书费用：在网银操作中，为了确保交易的安全性，企业需要使用数字证书进行身份认证，银行可能会收取一定的证书费用。

需要注意的是，不同银行在手续费的收取方式和标准上可能会有所不同，具体收费情况应以各个银行的公告和规定为准。另外，手续费的金额通常是根据企业的交易量和服务级别等因素而定，较大的交易量和高级别的服务往往能够享受更低的手续费率。