非上市公司自然人转让股份通常需要经过以下步骤：

1. 协商议定：转让方和受让方通过协商达成一致，确定转让股份的数量、价格和交易条件等。

2. 股权转让协议：双方签署股权转让协议，明确双方的权利和义务，包括转让方式、转让价格、转让条件、违约责任等。

3. 股东大会或股东决议：转让方通常需要获得公司其他股东的同意，可以通过召开股东大会或股东决议来进行表决并获得通过。

4. 股权过户：完成股权转让手续，包括填写股权转让书、办理公司内部手续、办理相关证照和文件的变更等。

5. 公告和备案：根据相关法律法规的规定，非上市公司可能需要在指定媒体上公告股权转让信息，并向相关管理部门备案。

6. 资金清算：受让方向转让方支付转让价款，完成资金交割。

7. 股权变更登记：根据相关法律法规的要求，将股权转让事项进行登记，确保受让方成为公司的新股东。

除上述步骤外，具体的转让流程还可能受到公司章程、合同约定、相关法律法规以及监管部门的规定等的影响。因此，在进行股份转让前，双方应仔细研究相关法律规定，并咨询专业律师或相关机构的意见，以确保转让的合法性和有效性。