新三板做市商是指在新三板市场上提供做市服务的机构或企业。其运作主要包括以下几个方面：

1. 做市商申请：机构或企业需要向中国证券登记结算有限责任公司（以下简称“中国结算”）申请成为新三板做市商，并满足相应的资格条件。申请通过后，做市商将被授予做市商资格。

2. 做市商义务：做市商需要履行一定的义务，包括提供做市报价、提供流动性支持、促进买卖双方交易等。做市商的报价一般会以一定的价差进行，即买入价和卖出价之间的差额，这个价差就是做市商的利润来源之一。

3. 做市商准备金：做市商需要缴纳一定的准备金作为保证金，以确保能履行交易的义务。准备金的多少与做市商的交易量相关，交易量越大，需要缴纳的准备金就越多。

4. 做市商风控：做市商需要建立风险控制体系，包括制定交易规则、设置风险监控指标、实施风险控制措施等。做市商需要及时发现和应对市场风险，以保证市场的稳定运行。

5. 做市商权益：做市商在履行做市义务的同时，也享有一定的权益，包括获得交易费用收入、获得市场流动性的提升等。做市商可以利用自己的市场优势进行交易，获取相应的利润。

总体来说，新三板做市商通过提供做市服务，为投资者提供流动性支持，提高市场的交易活跃度和效率。做市商通过履行做市义务和管理风险，既可以获取交易费用收入，也可以得到市场流动性的提升。这样的运作模式有助于新三板市场的健康发展。